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雲林縣流浪動物收容所由雲林縣動植物防疫所設立管理，是雲林縣唯一的公立動物收容機構，服務範圍涵蓋全縣20個鄉鎮市。與台灣多數縣市設有單一固定收容場所不同，雲林縣採取「委託代收容」模式，將流浪動物委託分散於各鄉鎮的合約動物醫院及代養場所收容，並定期公告最新的委託代養場所名冊及待認養動物資訊。認養人需先查詢目前有效的委託代養場所名冊，親自前往代養場所篩選適合的動物。縣政府並設有「四湖犬貓絕育站」，提供縣內飼主免費的犬貓絕育手術服務，積極落實源頭管理。雲林縣為農業縣，地廣人稀，流浪動物問題較為嚴峻，縣府持續透過多元管道擴大送養，包括定期辦理認養活動及透過動植物防疫所官網「汪喵認領養專區」公告待認養動物資訊。所有認養費用（含狂犬病疫苗、絕育手術、晶片植入及寵物登記）一律全免。

嘉義縣動物保護教育園區由嘉義縣家畜疾病防治所設立，位於民雄鄉松山村後山仔37之2號，於111年（2022年）9月2日正式啟用，是嘉義縣目前唯一的公立動物收容機構。園區建築設計別出心裁，利用屋頂斜角交錯規劃與中央通道的上升氣流，有效增加動物舍換氣量，搭配半開放式犬舍設計，提供犬隻開闊活動空間及適當日照時間。醫療設施完善，設有檢傷區、動物病舍、診療室及手術室，大幅提升收容動物的醫療水準。園區另設置毛小孩展示區及生命教育多媒體簡報室，定期舉辦多元活動以推廣認養及動物保護教育，積極活化社區參與。嘉義縣家畜疾病防治所行政辦公室位於太保市太保一路一號，與動物保護教育園區為不同地點，民眾如需至園區認養動物，請直接前往民雄鄉園區。

臺南市動物之家灣裡站由臺南市動物防疫保護處設立，位於南區省躬里萬年路580巷92號，是臺南市兩座公立動物之家之一（另一座為善化站）。灣裡站佔地約七百坪，設有行政作業區及收容作業區，收容全市南側各區捕捉的流浪犬貓及民眾通報救援的傷病動物，目前約收容400隻流浪動物。灣裡站的犬隻認養區欄位設計特別考量動物福利，每個欄位分設內外兩小區：外區供民眾參觀，內區則讓狗兒在不想被打擾時可自行退入休息，兼顧工作人員清潔管理與動物個別需求。與善化站相同，灣裡站認養人可享有臺南市免費絕育、狂犬病及七合一預防注射、內外寄生蟲驅除等完整服務，認養費用全免。